MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS02

Total Repeats: 4921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008704	GCG	2	6	432	437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855175
2	NC_008704	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855175
3	NC_008704	GCG	2	6	480	485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855175
4	NC_008704	CG	3	6	498	503	0 %	0 %	50 %	50 %	119855175
5	NC_008704	CGG	2	6	560	565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855175
6	NC_008704	TCG	2	6	778	783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855176
7	NC_008704	CGG	2	6	784	789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855176
8	NC_008704	CG	3	6	830	835	0 %	0 %	50 %	50 %	119855176
9	NC_008704	GGTC	2	8	836	843	0 %	25 %	50 %	25 %	119855176
10	NC_008704	TCC	2	6	862	867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119855176
11	NC_008704	GCT	2	6	887	892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855176
12	NC_008704	GGC	2	6	901	906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855177
13	NC_008704	TCG	2	6	978	983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855177
14	NC_008704	TCG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855177
15	NC_008704	CTC	2	6	1028	1033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119855177
16	NC_008704	CAG	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855177
17	NC_008704	CGA	2	6	1049	1054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855177
18	NC_008704	CAC	2	6	1055	1060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119855177
19	NC_008704	TCA	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119855177
20	NC_008704	CGT	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855177
21	NC_008704	CGT	2	6	1231	1236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855177
22	NC_008704	TGA	2	6	1237	1242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119855177
23	NC_008704	GGT	2	6	1268	1273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119855177
24	NC_008704	CAC	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119855177
25	NC_008704	GC	3	6	1291	1296	0 %	0 %	50 %	50 %	119855177
26	NC_008704	CAG	2	6	1394	1399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855177
27	NC_008704	CTC	2	6	1400	1405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119855177
28	NC_008704	GC	3	6	1470	1475	0 %	0 %	50 %	50 %	119855177
29	NC_008704	GCG	2	6	1487	1492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855177
30	NC_008704	CGG	2	6	1657	1662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855177
31	NC_008704	CCA	2	6	1727	1732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119855178
32	NC_008704	ACCGTG	2	12	1759	1770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855178
33	NC_008704	GCT	2	6	1826	1831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855178
34	NC_008704	GCG	2	6	1965	1970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855179
35	NC_008704	CCA	2	6	2008	2013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119855179
36	NC_008704	TCG	2	6	2025	2030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855179
37	NC_008704	GCT	2	6	2032	2037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855179
38	NC_008704	CGAC	2	8	2038	2045	25 %	0 %	25 %	50 %	119855179
39	NC_008704	CTG	2	6	2055	2060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855179
40	NC_008704	CAC	2	6	2068	2073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119855179
41	NC_008704	ATC	2	6	2130	2135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119855179
42	NC_008704	CCAG	2	8	2229	2236	25 %	0 %	25 %	50 %	119855179
43	NC_008704	CAC	2	6	2249	2254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119855179
44	NC_008704	CCGTC	2	10	2329	2338	0 %	20 %	20 %	60 %	119855179
45	NC_008704	CAA	2	6	2371	2376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119855179
46	NC_008704	AGG	2	6	2678	2683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119855180
47	NC_008704	CGC	2	6	2688	2693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855180
48	NC_008704	GGC	2	6	2694	2699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855180
49	NC_008704	GTC	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855180
50	NC_008704	CCGG	2	8	2722	2729	0 %	0 %	50 %	50 %	119855180
51	NC_008704	CGGC	2	8	2734	2741	0 %	0 %	50 %	50 %	119855180
52	NC_008704	CG	3	6	2772	2777	0 %	0 %	50 %	50 %	119855180
53	NC_008704	CCAG	2	8	2807	2814	25 %	0 %	25 %	50 %	119855180
54	NC_008704	TTC	2	6	2835	2840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119855180
55	NC_008704	CAG	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855180
56	NC_008704	GC	4	8	3107	3114	0 %	0 %	50 %	50 %	119855180
57	NC_008704	TGC	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855180
58	NC_008704	GCA	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855180
59	NC_008704	GAC	2	6	3213	3218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855180
60	NC_008704	GCC	2	6	3279	3284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855180
61	NC_008704	CAG	3	9	3357	3365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855180
62	NC_008704	GGC	2	6	3413	3418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855180
63	NC_008704	AGC	2	6	3442	3447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855180
64	NC_008704	GC	4	8	3446	3453	0 %	0 %	50 %	50 %	119855180
65	NC_008704	TCG	2	6	3479	3484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855180
66	NC_008704	ATCA	2	8	3495	3502	50 %	25 %	0 %	25 %	119855180
67	NC_008704	TGC	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855180
68	NC_008704	CAGC	2	8	3677	3684	25 %	0 %	25 %	50 %	119855181
69	NC_008704	CG	3	6	3685	3690	0 %	0 %	50 %	50 %	119855181
70	NC_008704	GAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119855181
71	NC_008704	CACC	2	8	3822	3829	25 %	0 %	0 %	75 %	119855181
72	NC_008704	CGT	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855181
73	NC_008704	GATC	2	8	3880	3887	25 %	25 %	25 %	25 %	119855181
74	NC_008704	CGC	2	6	3940	3945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855181
75	NC_008704	GAA	2	6	3988	3993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119855181
76	NC_008704	GCCC	2	8	4663	4670	0 %	0 %	25 %	75 %	119855182
77	NC_008704	TGC	2	6	4671	4676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855182
78	NC_008704	CGT	2	6	4712	4717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855182
79	NC_008704	AGT	2	6	4721	4726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119855182
80	NC_008704	GCG	2	6	4732	4737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855182
81	NC_008704	CCG	2	6	4759	4764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855182
82	NC_008704	GGC	2	6	4808	4813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855182
83	NC_008704	CGT	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855182
84	NC_008704	TCG	2	6	4825	4830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855182
85	NC_008704	GGT	2	6	4832	4837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119855182
86	NC_008704	CGT	2	6	4850	4855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855182
87	NC_008704	TCG	3	9	4870	4878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855182
88	NC_008704	TCG	2	6	4891	4896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855182
89	NC_008704	GT	3	6	4905	4910	0 %	50 %	50 %	0 %	119855182
90	NC_008704	G	6	6	4958	4963	0 %	0 %	100 %	0 %	119855182
91	NC_008704	GCG	2	6	5110	5115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855183
92	NC_008704	CGT	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855183
93	NC_008704	CGGC	2	8	5192	5199	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
94	NC_008704	TGG	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119855183
95	NC_008704	CCG	2	6	5216	5221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855183
96	NC_008704	CGG	2	6	5222	5227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855183
97	NC_008704	GC	3	6	5242	5247	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
98	NC_008704	CCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119855183
99	NC_008704	CGC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855183
100	NC_008704	GCC	2	6	5500	5505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855183
101	NC_008704	CGG	2	6	5528	5533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855183
102	NC_008704	TGC	2	6	5604	5609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855183
103	NC_008704	CGG	3	9	5618	5626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855183
104	NC_008704	CCGCGG	2	12	5630	5641	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
105	NC_008704	GCA	2	6	5648	5653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855183
106	NC_008704	CTG	2	6	5667	5672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855183
107	NC_008704	TGC	2	6	5722	5727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855183
108	NC_008704	GCA	2	6	5729	5734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855183
109	NC_008704	CGC	2	6	5748	5753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855183
110	NC_008704	GGC	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855183
111	NC_008704	GCT	2	6	5963	5968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855183
112	NC_008704	CGC	2	6	5973	5978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855183
113	NC_008704	GTG	2	6	6000	6005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119855183
114	NC_008704	CAG	2	6	6063	6068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855183
115	NC_008704	TGC	2	6	6093	6098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855183
116	NC_008704	CGGC	2	8	6155	6162	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
117	NC_008704	CG	4	8	6167	6174	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
118	NC_008704	CCCG	2	8	6181	6188	0 %	0 %	25 %	75 %	119855183
119	NC_008704	CTT	2	6	6216	6221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119855183
120	NC_008704	GGT	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119855183
121	NC_008704	CCG	2	6	6317	6322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855183
122	NC_008704	CAG	2	6	6408	6413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855183
123	NC_008704	TGT	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119855183
124	NC_008704	GTCG	2	8	6498	6505	0 %	25 %	50 %	25 %	119855183
125	NC_008704	CGGC	2	8	6627	6634	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
126	NC_008704	GCC	2	6	6700	6705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855183
127	NC_008704	GC	3	6	6732	6737	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
128	NC_008704	GCT	2	6	6740	6745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855183
129	NC_008704	CA	3	6	6766	6771	50 %	0 %	0 %	50 %	119855183
130	NC_008704	AGGC	2	8	6814	6821	25 %	0 %	50 %	25 %	119855183
131	NC_008704	CGC	2	6	6844	6849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855183
132	NC_008704	AGC	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855183
133	NC_008704	CGA	2	6	6888	6893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855183
134	NC_008704	GGT	2	6	6918	6923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119855183
135	NC_008704	CGG	2	6	6934	6939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855183
136	NC_008704	TCG	2	6	6952	6957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855183
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138	NC_008704	ACCGC	2	10	7049	7058	20 %	0 %	20 %	60 %	119855183
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151	NC_008704	GCG	2	6	7859	7864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855183
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159	NC_008704	TTG	2	6	8280	8285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119855184
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165	NC_008704	CGCCTC	2	12	8558	8569	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119855184
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253	NC_008704	TCG	2	6	11830	11835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855186
254	NC_008704	CGCA	2	8	11846	11853	25 %	0 %	25 %	50 %	119855186
255	NC_008704	CCA	2	6	11879	11884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119855186
256	NC_008704	CGC	2	6	11904	11909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855186
257	NC_008704	GCT	2	6	11921	11926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855186
258	NC_008704	CA	3	6	11970	11975	50 %	0 %	0 %	50 %	119855186
259	NC_008704	CACCGT	2	12	11994	12005	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119855186
260	NC_008704	CCGG	2	8	12020	12027	0 %	0 %	50 %	50 %	119855186
261	NC_008704	AGA	2	6	12043	12048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119855186
262	NC_008704	GAT	2	6	12054	12059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119855186
263	NC_008704	CGTG	2	8	12799	12806	0 %	25 %	50 %	25 %	119855187
264	NC_008704	GTC	2	6	12819	12824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855187
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389	NC_008704	CAG	2	6	18364	18369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855191
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